Hmmm, ich bin zweimal auf dem Seeweg angereist, aber mir fiele keine Begründung ein, warum Ihr den Flughafen nicht verlassen können solltet und wenn es mit Einreise per Visum ist. Die Einreisemodalitäten erfährst Du bei der Botschaft oder einem Konsulat, einfach mal googlen. Die Frage ist, ob Euer Gepäck durchgeroutet wird, aber wenn beide Flüge von Air Seychelles durchgeführt werden, sollte auch das kein Problem sein.
Eine andere Frage ist, wie gut Ihr im Flieger schlafen könnt und wie fit Ihr bei Ankunft seid, denn ich würde zu einer Tagestour mit Private Guide raten, der Euch am Flughafen abholt und wieder hinbringt. Gute Erfahrungen habe ich mit diesem Unternehmen gemacht. Sollte das Gepäck nicht durchgeroutet werden, werden die bestimmt eine passende Alternative nennen können.
Die Spezialisten hier werden es Dir aber bestimmt noch genauer erläutern.